怀孕两个月流褐色分泌物的原因可能是先兆流产、宫颈炎等。建议及时去医院检查，查明原因，遵医嘱治疗。

1.先兆流产：表现为阴道少量棕色分泌物，随后出现阵发性下腹痛或腰痛。体格检查显示子宫大小与孕周一致。按照医生的建议休息并服用药物（如黄体酮）以保护胎儿。治疗后症状消失的患者可以继续怀孕。如果症状恶化或超声波显示胚胎发育不良，建议患者应终止妊娠。

2.宫颈炎： - 宫颈息肉：妊娠早期在同一房间内可导致接触性出血。阴道内积聚的少量出血会逐渐变成棕色分泌物，建议患者做妇科检查后确定。需要及时切除并送病理检查。 - 慢性宫颈炎：由于宫颈糜烂样改变，也会引起阴道棕色分泌物。建议怀孕两个月流褐色分泌物的患者要做好生活护理，平时多注意休息，稳定好情绪，避免过于激动。建议及时去医院产科就诊，以免意外发生。